Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms