Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shcbp1Q9Z179 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms