Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema4fQ9Z123 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms