Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stau1Q9Z108 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stau1Q9Z108 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms