Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms