Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms