Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itsn2Q9Z0R6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Itsn2Q9Z0R6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms