Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc6Q9R1S7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms