Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C8

Htr6, 5-hydroxytryptamine receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr6Q9R1C8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr6Q9R1C8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr6Q9R1C8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms