Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htra1Q9R118 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htra1Q9R118 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms