Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed2Q9R0Q3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed2Q9R0Q3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms