Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpk1Q9R0M5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpk1Q9R0M5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms