Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zeb2Q9R0G7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms