Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf346Q9R0B7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms