Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nubp1Q9R060 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nubp1Q9R060 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms