Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AmfrQ9R049 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmfrQ9R049 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms