Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf4Q9QZS2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf4Q9QZS2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms