Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Col4a3Q9QZS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Col4a3Q9QZS0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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