Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copg1Q9QZE5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copg1Q9QZE5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms