Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChmlQ9QZD5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms