Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc3Q9QZC1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc3Q9QZC1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms