Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nr4a3Q9QZB6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a3Q9QZB6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms