Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn8Q9QZ49 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn8Q9QZ49 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms