Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Exo1Q9QZ11 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms