Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phtf1Q9QZ09 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Phtf1Q9QZ09 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms