Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms