Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip4Q9QXN3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms