Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Rad18Q9QXK2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad18Q9QXK2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms