Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trp53inp1Q9QXE4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trp53inp1Q9QXE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms