Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dkk3Q9QUN9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk3Q9QUN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms