Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms