Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolkQ9QUG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolkQ9QUG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms