Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja4Q9JMC3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms