Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cabp1Q9JLK7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cabp1Q9JLK7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms