Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col5a3Q9JLI2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms