Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tmod4Q9JLH8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmod4Q9JLH8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms