Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot9Q9JKY0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms