Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk3aQ9JKX8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk3aQ9JKX8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms