Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nova1Q9JKN6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nova1Q9JKN6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms