Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl39Q9JKF7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms