Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ybx3Q9JKB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms