Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnga3Q9JJZ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnga3Q9JJZ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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