Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2j1Q9JJZ4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms