Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms