Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpf2Q9JJ80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpf2Q9JJ80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms