Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smad9Q9JIW5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smad9Q9JIW5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms