Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms