Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms