Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim2Q9ESN6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms