Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hapln2Q9ESM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hapln2Q9ESM3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms